中枢神经系统肿瘤中，室管膜瘤的组织学分级与预后关系不大，与部位还有分子改变的关系比较大。在幕上、幕下、脊椎三个部位的预后都不同：幕上的II级III级是预后不好的，幕下的儿童患者的II级III级是预后不好的，其他都是预后好的。2021版CNS分类中，幕上室管膜瘤的YAP1-MAMLD融合阳性预后好，可用YAP1断裂探针替代检测。